Kurangnya zat seng dalam jaringan tanaman menyebabkan tulang daun tanaman padi yang masih muda mengalami klorosis khususnya di bagian pangkal, timbul bercak dan garis-garis coklat pada daun di bagian bawah, pertumbuhan terhambat (tanaman kerdil), tunas sedikit, ukuran daun kecil, dan pertumbuhan tidak merata.